Rinnovo del permesso di soggiorno

Buongiorno, 
Con la presente gradirei avere alcuni chiarimenti in merito alla procedura per rinnovare un permesso di soggiorno.
Io sono un cittadino Italiano. La mia compagna (con cui convivo da 8 anni) e' una cittadina extra ue (indonesiana). Ora, grazie al DPCM "ricongiungimento per comprovate relazioni affettive" si trova in Italia con dicitura del VISTO "Famiglia/Turismo/Amici con validita' di 2 anni, ma massima durata del soggiorno 90 giorni. Poiche' stiamo attendendo tutta la documentazione della mia compagna tramite l'ambasciata indonesiana di Roma, questo comportera' dei tempi stimati di oltre 2 mesi e cosi facendo rischiamo di essere oltre i
limiti dei 90 giorni del soggiorno. Chiedevo dunque se c'e' possibilita' di rinnovo (ed in caso quale procedura seguire) dell'attuale visto per evitare di doverla farla "uscire" dall'Italia per ottemperare alla tempistica della nostra
unione civile. Grazie anticipatamente
Benvenuto, dalla provincia di RO