Rinnovo permesso di soggiorno

Buonasera,
Da marzo che ho presentato la richiesta di rinnovo del permesso di soggiorno, settimana scorsa ho dovuto cancellare un viaggio di lavoro ad Amsterdam, perché non avendo il permesso non posso viaggiare in Europa, ma ora il problema è che devo viaggiare al mio paese (Costa Rica) e non esiste un volo diretto, devo fare Roma-Spagna-Costa Rica e viceversa, vorrei sapere se posso farlo con la ricevuta.
Il problema secondo quello che hanno detto alla questura è che ho cambiato da permesso di soggiorno per ricongiungimento famigliare (ero sposata con un cittadino italiano, ora sono separata legalmente) per quello di lavoro e anche se i documento sono tutti a posto loro hanno rallentato il processo per colpa della separazione, è normale? Se è tutto a posto con i documenti non dovrebbero semplicemente continuare il tramite?
Grazie
Vane, dalla provincia di LT