Problemi con il contratto di soggiorno

Buongiorno,
sono residente in Italia da 6 anni. Ho un regolare permesso di soggiorno per motivi di lavoro che rinnovavo ogni anno avendo sempre lavorato a tempo
determinato. Quest'anno ho fatto la richiesta per la carta di soggiorno. Tutti i documenti sono a posto tranne che manca il contratto di soggiorno. L'azienda
non l'ha fatto, pensando che il mio paese faccia parte dell'Unione europea. E quindi mi hanno assunta senza farmi il contratto di soggiorno. Io lavoro per questa ditta da più di un anno ed il contratto è finito da poco (essendo la seconda proroga ci lasciano a casa per richiamarci di nuovo dopo un
mese o due), per cui sono disoccupata per il momento. La questura della mia città vuole invece questo contratto di soggiorno che invece non è mai stato fatto, in azienda mi dicono che non lo possono fare essendo questa una cosa retroattiva. Ho chiesto anche in prefettura cosa devo portare e mi hanno detto che secondo loro basta una dichiarazione dell'azienda dove dicono che effettivamente non hanno mai fatto il contratto di soggiorno. La mia pratica per la richiesta della carta di soggiorno intanto è in sospeso in attesa di questi due documenti (il contratto di soggiorno e la ricevuta delle poste
che dimostra che il contratto è stato mandato allo sportello unico per l'immigrazione) che non sono mai stati fatti e indietro non si può tornare purtroppo. Volevo sentire la vostra opinione al riguardo.
Distinti saluti
Alessandra, da Venezia (VE)