Permessi in ritardo? Si puo' fare la messa in mora dell'amministrazione!

Buon giorno vi scrivo per porvi questo quesito. mia moglie e' cittadina di Hong Kong. Ci siamo sposati il 5 febbraio 2007 a Hong Kong. Siamo rientrati in Italia il 21 febbraio chiedendo il permesso di soggiorno (ancora non arrivato). Per entrare in Italia mia moglie non ha avuto bisogno di visto (quindi poteva risiedere in Italia 90 giorni e quindi fino al 21 maggio). Al momento e' quindi priva di visto! In questura mi hanno detto che non ce ne bisogno (il visto serve per entrare ma non per risiere!?). Che mi dite?