Negazione visto per lavoro autonomo

Buon giorno, sono un cittadino italiano fidanzato con una ragazza colombiana. Nell'estate scorsa la mia fidanzata è stata in Italia per un breve periodo di vacanza con visto turistico. Successivamente è rientrata in patria dove ha chiesto all'ambasciata italiana un visto di soggiorno per lavoro autonomo, come contabile dato che è laureata e aveva trovato lavoro qui in Italia. Il suo titolare infatti ha preparato tutta la documentazione necessaria, compreso il nulla osta della questura di milano, e li ha inviati a lei in Colombia. L'ambasciata ha negato il visto dando come motivazione che l'azienda in Italia non ha sufficiente bilancio attivo... (e di rivolgersi al TAR per controversie).. cosa che mi pare strana essendo una azienda che ha piu' di 10 anni e con svariati dipendenti e immobili. Ovviamente per ragioni fiscali, forse l'azienda ha un bilancio basso... ma ha sempre pagato fornitori e dipendenti e non ha debiti con nessuno. Mi date cortesemente un aiuto, consigliandomi come fare per farle ottenere il permesso di soggiorno?
Vi ringrazio anticipatamente
Flavio, da San Vittore Olona (MI)