Agenzia entrate iva prima casa

Nel 2001 ho ricevuto tramite donazione dei miei genitori solo la nuda proprietà della loro casa. La donazione è stata fatta a me ed a mia sorella che era quella che ne aveva reale bisogno. Io ho ricevuto sola la nuda proprietà dell'appartamento dei miei genitori, mentre lei l'appartamento sottostante; comunque ad ognuno un appartamento diverso. Nel 2004 ho acquistato effettivamente la mia prima casa presso la quale ho trasferito fin da subito la residenza usufruendo delle agevolazioni prima casa. Oggi 08-06-2009 mi vedo recapitare un plico dell'agenzia delle entrate dove mi richiedono di versare la differenza di iva non pagata per l'acquisto della mia prima casa. Ora mi domando, ma se la casa nel 2001 mi è stata donata dai miei perchè nel 2004 non potevo comprare la mia casa con tutte le agevolazioni come ho fatto. Cosa posso fare visto che mi vedo costretto a pagare l'iva per differenza sulla seconda casa che in realtà è la mia vera prima casa e che è anche in un altro comune?
Alberto, da Brembate (BG)